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可与无虹膜症同时出现的主要疾病包括：
一、米勒氏症候群(Miller syndrome)：偶发性无虹膜症的患者中约有30%，可併发威尔姆氏肿瘤(一般在五岁以前发作)，称之为米勒氏症候群；其他病症还包括生殖泌尿道异常、智能迟钝、颅颜畸形等。
二、葛拉斯彼氏症候群(Gillespie syndrome)：无虹膜症併有小脑运动失调及智能迟钝时，称之为葛拉斯彼氏症候群；此疾为隐性遗传，虽有无虹膜症但病因不在PAX6基因，所以不会发生威尔姆氏肿瘤，主要病灶为小脑及部分大脑的发育不良。
三、青光眼：青光眼是无虹膜症的主要视力丧失原因；一般多要到成年时才会发作，主要是因为前房隅角被残馀的虹膜组织阻塞。
四、白内障：相关的白内障种类包括前极型、锥型、皮质型、层型、核型等；如果在出生时发现有明显的白内障，就需要适时的手术以避免发生弱视。
五、水晶体移位
六、角膜异常：一般多为小角膜、角膜混浊、及角膜血管翳(一般在两岁前，由上下两侧角膜开始发生)等；目前认为病因可能与角膜轮部干细胞(limbal stem cells)的不正常有关。
七、视神经与黄斑视小凹发育不良：主要造成视力减退及眼球震颤的原因；视神经或黄斑发育不良的程度与虹膜的缺损程度并无关联。
八、斜视：主要会发生内斜视。
九、眼球震颤：可发生先天性眼球震颤，主要为钟摆式眼球震颤(pendular nystagmus)；特点为两眼规律且对称的眼球震颤。
无虹膜症的患者，都需要接受完整的基因筛检与全身检查，甚至直系亲属也应一同接受完整眼科检查。至于无虹膜症的治疗主要针对屈光不良、角膜混浊、白内障、及青光眼等，但因为到目前为止仍没有较佳的无虹膜症治疗方式，一般预后皆不良。
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