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显微镜下菌种形态或染色差异-细菌观察研究
真菌鉴定技术
真菌传统检测方法是由培养基上的菌落外观、显微镜下菌种形态或染色差异等来鉴定
菌种，然而真菌外观极为相近，容易造成鉴定错误，以物种的分类界、门、纲、目、科、
属、种來看，以显微镜鉴定菌种准确性往往只能达到菌属（genus）而不能深入到菌种
（species），但惟有鉴定至菌种才可确认其危害性。加上空气采样真菌的菌量相当可观，生
长速度慢，若要一一鉴定，并不是一项容易的工作。
由于分子技术的开发， 3种常用于菌种之基因鉴定法为：
(1) 聚合酶连锁反应或定量聚合酶连锁反应（polymerase chain reaction, PCR 或
qPCR）：可放大每种菌独特之基因片段，也就是只有该种菌种之基因才可被放大
而被侦测到。这种方法受限在一次只能进行一种菌的鉴識，且菌种序列必须为已
知。
(2) DNA 定序法（DNA sequencing）：针对菌种部分基因放大后，将该片段基因之核
酸序列以 Sanger 定序法判读出來。这种方法最可确认菌种的正确性，但首要是
溷合二种菌时会造成判读溷亂，故必先确保其为单一菌种。
(3) 限制性片段多样性（restriction fragment length polymorphism, RFLP）：先以 PCR 放
大某一基因，再以特定的限制酶（restriction enzyme）进行剪切后，以电泳确认基
因片段大小（size）。由于每种菌剪切之片段不一，可用以分辨菌种。
以上所述的方法，各有其优劣
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